Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pitpnm1O35954 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pitpnm1O35954 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pitpnm1O35954 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pitpnm1O35954 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pitpnm1O35954 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pitpnm1O35954 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pitpnm1O35954 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pitpnm1O35954 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pitpnm1O35954 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pitpnm1O35954 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pitpnm1O35954 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pitpnm1O35954 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pitpnm1O35954 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pitpnm1O35954 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms