Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FxnO35943 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FxnO35943 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FxnO35943 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FxnO35943 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FxnO35943 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FxnO35943 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FxnO35943 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FxnO35943 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FxnO35943 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FxnO35943 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FxnO35943 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FxnO35943 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FxnO35943 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FxnO35943 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FxnO35943 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FxnO35943 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FxnO35943 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FxnO35943 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FxnO35943 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FxnO35943 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FxnO35943 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FxnO35943 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FxnO35943 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FxnO35943 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FxnO35943 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FxnO35943 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FxnO35943 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FxnO35943 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FxnO35943 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FxnO35943 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FxnO35943 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FxnO35943 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FxnO35943 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FxnO35943 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FxnO35943 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FxnO35943 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FxnO35943 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FxnO35943 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FxnO35943 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FxnO35943 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FxnO35943 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FxnO35943 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FxnO35943 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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FxnO35943 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FxnO35943 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FxnO35943 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FxnO35943 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FxnO35943 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FxnO35943 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FxnO35943 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FxnO35943 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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FxnO35943 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FxnO35943 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FxnO35943 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FxnO35943 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FxnO35943 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FxnO35943 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FxnO35943 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FxnO35943 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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FxnO35943 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FxnO35943 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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FxnO35943 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FxnO35943 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FxnO35943 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FxnO35943 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FxnO35943 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FxnO35943 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FxnO35943 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FxnO35943 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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FxnO35943 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FxnO35943 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FxnO35943 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FxnO35943 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FxnO35943 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FxnO35943 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FxnO35943 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FxnO35943 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FxnO35943 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FxnO35943 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FxnO35943 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FxnO35943 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FxnO35943 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FxnO35943 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FxnO35943 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FxnO35943 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FxnO35943 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FxnO35943 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FxnO35943 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FxnO35943 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FxnO35943 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FxnO35943 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FxnO35943 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FxnO35943 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms