Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chil3O35744 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Chil3O35744 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chil3O35744 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chil3O35744 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chil3O35744 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chil3O35744 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chil3O35744 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chil3O35744 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chil3O35744 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Chil3O35744 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chil3O35744 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chil3O35744 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chil3O35744 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chil3O35744 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chil3O35744 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms