Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc1O35704 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc1O35704 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc1O35704 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sptlc1O35704 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptlc1O35704 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sptlc1O35704 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sptlc1O35704 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sptlc1O35704 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sptlc1O35704 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sptlc1O35704 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms