Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sema6aO35464 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6aO35464 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sema6aO35464 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sema6aO35464 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sema6aO35464 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms