Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casq1O09165 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casq1O09165 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casq1O09165 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Casq1O09165 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casq1O09165 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casq1O09165 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casq1O09165 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casq1O09165 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casq1O09165 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casq1O09165 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casq1O09165 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casq1O09165 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Casq1O09165 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casq1O09165 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms