Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sprr3O09116 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sprr3O09116 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms