Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NumblO08919 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NumblO08919 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NumblO08919 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NumblO08919 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NumblO08919 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NumblO08919 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NumblO08919 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NumblO08919 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NumblO08919 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NumblO08919 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NumblO08919 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NumblO08919 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NumblO08919 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NumblO08919 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NumblO08919 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NumblO08919 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NumblO08919 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NumblO08919 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NumblO08919 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NumblO08919 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NumblO08919 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NumblO08919 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NumblO08919 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NumblO08919 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NumblO08919 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NumblO08919 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NumblO08919 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NumblO08919 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NumblO08919 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NumblO08919 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NumblO08919 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NumblO08919 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NumblO08919 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NumblO08919 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NumblO08919 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NumblO08919 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NumblO08919 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NumblO08919 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NumblO08919 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NumblO08919 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NumblO08919 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NumblO08919 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NumblO08919 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NumblO08919 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NumblO08919 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NumblO08919 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NumblO08919 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NumblO08919 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NumblO08919 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NumblO08919 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NumblO08919 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NumblO08919 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NumblO08919 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NumblO08919 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NumblO08919 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NumblO08919 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NumblO08919 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NumblO08919 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NumblO08919 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NumblO08919 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NumblO08919 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NumblO08919 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NumblO08919 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NumblO08919 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NumblO08919 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NumblO08919 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NumblO08919 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NumblO08919 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NumblO08919 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NumblO08919 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NumblO08919 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NumblO08919 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NumblO08919 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NumblO08919 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NumblO08919 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NumblO08919 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NumblO08919 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NumblO08919 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NumblO08919 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NumblO08919 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NumblO08919 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NumblO08919 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NumblO08919 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NumblO08919 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NumblO08919 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NumblO08919 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NumblO08919 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NumblO08919 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NumblO08919 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms