Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eftud2O08810 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Eftud2O08810 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eftud2O08810 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms