Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PrkcshO08795 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PrkcshO08795 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrkcshO08795 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkcshO08795 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms