Protein–RNA interactions for Protein: O08792

Ebf2, Transcription factor COE2, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf2O08792 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf2O08792 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf2O08792 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ebf2O08792 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ebf2O08792 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms