Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp12O08736 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp12O08736 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp12O08736 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp12O08736 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp12O08736 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp12O08736 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp12O08736 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp12O08736 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp12O08736 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Casp12O08736 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casp12O08736 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Casp12O08736 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casp12O08736 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casp12O08736 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casp12O08736 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp12O08736 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp12O08736 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp12O08736 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp12O08736 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp12O08736 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp12O08736 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp12O08736 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp12O08736 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp12O08736 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp12O08736 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp12O08736 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp12O08736 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp12O08736 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp12O08736 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Casp12O08736 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Casp12O08736 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp12O08736 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casp12O08736 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms