Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rundc3aO08576 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rundc3aO08576 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rundc3aO08576 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms