Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efna3O08545 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efna3O08545 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efna3O08545 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efna3O08545 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efna3O08545 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna3O08545 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efna3O08545 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna3O08545 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efna3O08545 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna3O08545 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efna3O08545 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms