Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ascl4M0QW46 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl4M0QW46 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ascl4M0QW46 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ascl4M0QW46 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms