Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5849J3QPE5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5849J3QPE5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5849J3QPE5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5849J3QPE5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5849J3QPE5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5849J3QPE5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5849J3QPE5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5849J3QPE5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5849J3QPE5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5849J3QPE5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5849J3QPE5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5849J3QPE5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms