Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY1

Gm9242, Predicted pseudogene 9242, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9242J3QNY1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9242J3QNY1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm9242J3QNY1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms