Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam240aJ3QNP9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam240aJ3QNP9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam240aJ3QNP9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam240aJ3QNP9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam240aJ3QNP9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms