Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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