Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r67G5E8C1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r67G5E8C1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r67G5E8C1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r67G5E8C1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms