Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Atp2b1G5E829 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Atp2b1G5E829 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Atp2b1G5E829 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Atp2b1G5E829 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,8 ms