Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp2b1G5E829 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2b1G5E829 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2b1G5E829 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b1G5E829 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms