Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sh3tc1G3X9F6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh3tc1G3X9F6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3tc1G3X9F6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms