Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Arid4aF8VPQ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Arid4aF8VPQ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Arid4aF8VPQ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Arid4aF8VPQ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Arid4aF8VPQ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Arid4aF8VPQ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Arid4aF8VPQ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Arid4aF8VPQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,6 ms