Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21970F6XX07 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21970F6XX07 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms