Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10378F6XQQ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10378F6XQQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10378F6XQQ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms