Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf165E9QAU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf165E9QAU8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf165E9QAU8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf165E9QAU8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf165E9QAU8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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