Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L6

Foxn2, Forkhead box N2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn2E9Q7L6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxn2E9Q7L6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxn2E9Q7L6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxn2E9Q7L6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxn2E9Q7L6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Foxn2E9Q7L6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxn2E9Q7L6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxn2E9Q7L6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxn2E9Q7L6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxn2E9Q7L6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxn2E9Q7L6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxn2E9Q7L6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms