Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtproE9Q612 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtproE9Q612 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtproE9Q612 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtproE9Q612 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms