Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Setd2E9Q5F9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Setd2E9Q5F9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Setd2E9Q5F9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms