Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r48E9Q5D8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r48E9Q5D8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms