Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ApobE9Q414 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ApobE9Q414 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ApobE9Q414 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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