Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd1E9Q3H4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd1E9Q3H4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Susd1E9Q3H4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms