Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3250E9Q1M3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3250E9Q1M3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3250E9Q1M3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3250E9Q1M3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms