Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0E7

Vmn2r115, Vomeronasal 2, receptor 115, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r115E9Q0E7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r115E9Q0E7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r115E9Q0E7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r115E9Q0E7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r115E9Q0E7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms