Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdr1E9Q0B4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cdr1E9Q0B4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdr1E9Q0B4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdr1E9Q0B4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms