Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B3

Uncharacterized membrane protein C3orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9Q0B3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9Q0B3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9Q0B3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9Q0B3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9Q0B3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9Q0B3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9Q0B3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9Q0B3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E9Q0B3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9Q0B3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E9Q0B3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9Q0B3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E9Q0B3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms