Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fndc1E9Q043 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fndc1E9Q043 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Fndc1E9Q043 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Fndc1E9Q043 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fndc1E9Q043 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fndc1E9Q043 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms