Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Brd1E9PZ26 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brd1E9PZ26 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Brd1E9PZ26 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brd1E9PZ26 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms