Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931429L15RikE9PVU2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931429L15RikE9PVU2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931429L15RikE9PVU2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931429L15RikE9PVU2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931429L15RikE9PVU2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms