Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc62E9PVD1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc62E9PVD1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc62E9PVD1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms