Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930444G20RikD3Z741 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930444G20RikD3Z741 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930444G20RikD3Z741 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930444G20RikD3Z741 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms