Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem200bD3Z0P8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem200bD3Z0P8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200bD3Z0P8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms