Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ldlrad1D3YYZ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ldlrad1D3YYZ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ldlrad1D3YYZ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ldlrad1D3YYZ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms