Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1500009C09RikD3YYW9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1500009C09RikD3YYW9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1500009C09RikD3YYW9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1500009C09RikD3YYW9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1500009C09RikD3YYW9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1500009C09RikD3YYW9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1500009C09RikD3YYW9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1500009C09RikD3YYW9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1500009C09RikD3YYW9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms