Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samd1D3YXK1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd1D3YXK1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samd1D3YXK1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samd1D3YXK1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms