Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc13D3YV10 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc13D3YV10 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc13D3YV10 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms