Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3259D3YUK0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3259D3YUK0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3259D3YUK0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms