Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nxpe3B9EKK6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxpe3B9EKK6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nxpe3B9EKK6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nxpe3B9EKK6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms