Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tmf1B9EKI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tmf1B9EKI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tmf1B9EKI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Tmf1B9EKI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tmf1B9EKI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
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