Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20547B8JJN0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20547B8JJN0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20547B8JJN0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms